不合法。根据我国劳动法规定,用人单位不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资,也不得随意延长劳动者的工作时间。如果劳动者辞职,应该按照规定进行工作交接,但不应该因此而扣发劳动者的工资。如果用人单位扣发了劳动者的工资,属于违法行为。
此外,我国劳动法还规定了用人单位应当按照约定支付高于劳动者正常工作时间工资的工资报酬,其中包括延长工作时间、休息日安排工作又不能安排补休和法定休假日安排劳动者工作等情况。在这种情况下,用人单位扣百分之二十的工资也是不合法的。
因此,如果用人单位扣发了劳动者的工资,建议劳动者及时向劳动监察部门投诉举报,维护自己的合法权益。
(注:以上内容仅供参考,具体法律问题请咨询专业律师。)